鱼蛋白胨它作为微生物培养基的主要原料，在抗生素，医药工业，发酵工业。实验室用作培养基，培养细菌。食品中用作**蛋白含量。用于饲料中显著降低了饲料厂的生产成本，是饲料行业中蛋白源不足的良好佳品。

液体鱼蛋白胨饲料是利用水产品加工废水或低值鱼，切碎后加入一定量的酸或微生物发酵，通过鱼体自溶酶，使其液化为浆制品。因为这种蛋白胨饲料储存质量，它也被成为有质量的蛋白胨饲料。

鱼蛋白胨饲料产量和使用的类型的酶，酶浓度，酶抑制剂和稳定剂的添加量和溶解条件影响很大。使用普乐鱼乳液为原料，在自溶的影响较小的情况下生产的食用鱼粉，用三种不同的酶，回收率相比后试验结果表明，灰色链霉菌蛋白酶活性的40000单位/克，总溶解氮达到百分之八十九，而其他的细菌蛋白胨酶（多粘芽孢杆菌和芽孢杆菌）总氮产量仅达百分之六十五和百分之四十五。产品有苦涩味和原料的种类，酶的种类和溶解条件。

利用灰色链霉菌蛋白酶可以食用，但是有些略苦的产品,和牛肉浸膏的气味差不到。鱼去头，骨和内脏与芽孢杆菌蛋白酶酶解可以大大降低产品的苦。选择酶不仅要考虑它的溶解能力，但也看到它在产品的生产和残留的气味。在肉糜中加入缓蚀剂（如聚磷酸盐，氯化钠）可以减少产量鱼粉。如果预定的烹饪原料，大多数的蛋白胨仍然在不溶性部分，使鱼蛋白胨饲料产量减少。